У вас есть s = df.groupby("user_id").size(). Что нужно сделать, чтобы получить DataFrame с колонками user_id и cnt для дальнейшего .merge()?

После .groupby(...).size() вы получаете Series, где индекс — ключ группировки (user_id), а значения — количество строк в группе. Для объединений через .merge() чаще удобнее иметь явный столбец с ключом, поэтому применяют reset_index(name="cnt"). Это превратит индекс в колонку user_id и создаст колонку cnt со счетчиками.